Lara è alla ricerca del vero Amuleto di Horus conservato nella tomba di Amenhotep (o Achnaton), ma quando lascia la tomba un numeroso gruppo di figli del deserto la circonda e le sottrae tutte le munizioni e l'Amuleto appena recuperato. I ninja decidono infine di ucciderla, ma Lara riesce a scappare rubando una jeep parcheggiata lì vicino, anche se non farà molta strada visto che i ninja, sparando ai pneumatici, fermano improvvisamente la jeep facendo cadere Lara in un profondo, piccolo buco buio e sinistro dove poi decidono di lasciarla..

Lara esplora la zona circostante e scopre l'esistenza di un tunnel che conduce ad un antico, dimenticato Tempio. Ora il suo unico obiettivo è trovare il modo di uscire e recuperare l'Amuleto ad ogni costo..